Ребутнулся сервер и с виду ничего не подавало знаки каких либо повреждений.
Но, в логах заметил ошибку записи в одну из таблиц.
Решил проверить и поймал вот такую ошибку

Table is marked as crashed and should be repaired

Решается такая ошибка очень просто и есть несколько способов:

sudo mysqlcheck -uroot -p --repair --all-databases

проверит и попытается починить все бд

mysql -u root;
USE my_data_base;
REPAIR TABLE my_table_name;

починит нашу таблицу

После данных манипуляций, таблица снова дышит и редактируется.